与人类和其它哺乳动物疾病一样，大熊猫疾病通常分内科病、外科病、产科病、传染病和寄生虫病。虽然经过长期的进化和环境改变，大熊猫已经从以肉食类食物逐步演变到今天的以植物性食物-竹子为主食的生理特点，但她在分类学上仍然属于食肉目凶猛动物，拥有发达的咬肌、锋利的牙齿、敏捷的爪子。别看她平时憨态可拘、温文尔雅，一旦发起怒来是非常凶猛的和难以控制的。即便是患病的大熊猫，一般都无法接近，科学家们不得不首先通过麻醉让她熟睡后才能够完成对她的检查、诊断和治疗。因此，要想成为一名真正的大熊猫医生，必须熟练掌握大熊猫的麻醉技术。

大熊猫的内科疾病主要表现在消化系统、呼吸系统、泌尿系统、神经系统、造血系统等。最常见的疾病有急性胃肠炎、慢性胃肠炎、感冒、肺炎等；对大熊猫生命安全最具有威胁的疾病主要包括：中暑、肠梗阻、肠钮转、肠套叠、急性胰腺炎、肾功能衰竭等。

大熊猫外科疾病最常见的外伤、骨折、颅脑损伤、肿瘤等，这些疾病都必须通过外科手术才能完成治疗。但由于大熊猫会不停地抓扯伤口从而破坏伤口的愈合，因此，大熊猫外科疾病治疗成功的关键在于手术后的护理。

　大熊猫产科疾病主要包括：假孕、流产、难产、外阴水肿、子宫内膜炎、卵巢囊肿、输卵管堵塞、不育症等。最常见的疾病主要有假孕、流产。大熊猫初生幼仔体重只占母体重量的1/1000，因为胎儿个体大小发生难产的可能性极小，最大的可能性通常都发生于母兽分娩时子宫收缩无力而出现产力性难产。到目前为止：全球范围内仅报道了一例大熊猫的难产。该病例发生于2004年的成都大熊猫繁育研究基地大熊猫个体“二丫头”（谱系号：401#）。当年，“二丫头”在第1次破羊水后14小时一直未表现出阵缩和努责，专家们通过B超检查发现胎儿一直停留在子宫内，最后通过中西药联合处理的保守治疗方法，最后将死亡胎儿排出母体外，避免了一场外科手术的发生，最大限度地保护了大熊猫“二丫头”。
 

大熊猫传染病是一类对大熊猫种群健康和生命安全具有极大威胁的疾病。每当一种新型传染病来临而又完全被科学家认识以前，往往会防不胜防，会给整个大熊猫圈养种群造成非常严峻的损失甚至是毁灭性的打击。就象人类传染病SARS和禽流感刚来临在全人类引起的恐慌一样。在圈养大熊猫的历史上，如上世纪八十年代因为抢救野外大熊猫而传入圈养种群的由侵袭性大肠杆菌O152引起的出血性肠炎，2年内导致了近20只大熊猫死亡；轮状病毒导致大熊猫断奶幼兽顽固性腹泻病和慢性营养不良综合症、犬瘟热病毒导致的熊猫瘟热病、细小病毒导致的大熊猫病毒性肠炎等都曾给整个圈养种群造成过极大的伤害。

　　经过全世界科学家们的共同努力，目前在大熊猫已知传染病的治疗和预防上已经取得了重大突破。专家们已经成功地找到了诸如侵袭性大肠杆菌O152引起的大熊猫出血性肠炎、轮状病毒感染导致的大熊猫断奶幼兽顽固性腹泻病和慢性营养不良综合症等病的有效治疗方法和预防措施，并已经筛选出专门用于大熊猫抗击犬瘟热病毒感染的预防疫苗。

在大熊猫疾病预防和控制领域，成都大熊猫繁育研究基地先后攻克的难题包括：
1、大熊猫出血性肠炎病（侵袭性大肠杆菌EIEC O152感染）防治技术；

2、圈养大熊猫寄生虫病防治与净化技术；

3、大熊猫慢性营养不良综合症防治技术；

4、大熊猫病毒性心肌炎防治技术；

5、大熊猫断奶幼兽急性顽固性腹泻病（轮状病毒感染）防治技术；

6、犬瘟热弱毒疫苗对大熊猫抗犬瘟热病毒感染的免疫保护效果评估；

7、犬细小病毒弱毒疫苗对大熊猫抗细小病毒感染的免疫保护效果评估；

8、犬副流感弱毒疫苗对大熊猫抗副流感病毒感染的免疫保护效果评估；

9、雪貂犬瘟热重组疫苗对大熊猫种群的安全性评估；

10、大熊猫耐甲氧西林葡萄球菌性肺炎防治技术；

11、大熊猫牙髓炎根治技术；

12、大熊猫感染性血尿症病原检定与防治；

13、大熊猫吸入麻醉与麻醉监护技术。